Theoretical Biophysics Symposium

Workshops

When

2003/03/05 - 2003/03/07

Place

Donostia - San Sebastián

Organizers

Prof. J.M. Ugalde, Prof. J.M. Llunch, Prof. L.A. Eriksson y Prof. J. Andrés

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iCal

Chairmen:
Prof J. M. LLuch (Universitat Autònoma de Barcelona, Spain)
Prof L. A. Eriksson (Uppsala Universitet, Sweden)
Prof J. Andres (Universitat Jaume I, Spain)
Prof J. M. Ugalde (Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain)

Biofisika Teorikoko Nazioarteko Symposium-a DIPC-n
Konputagailuak eta algoritmo konputazionalak gero eta garrantzi handiagoa hartzen ari dira Zientzia Natutalen garapenean. Biokimikaren arloan, modelizazio konputazionala, besteak beste, hainbat molekulen toxikotasuna edo beste hainbaten onuragarritasuna ulertzeko, erradiazio ultramorearen eragina ADN-arengan edota farmako berri eta erangikorragoak egiteko, erabiltzen da.
Martxoaren 5-etik 7-ra bitartean, Donostia International Physics Center, DIPC-k, UPV/EHU-ko kimika teorikoko eta Suediako Uppsala-ko Unibertsitateko Biofisika taldeekin batera, Biofisika Teorikoko Nazioarteko Symposium bat antolatu zuen. Bertara 50 bat delegatu etorriko ziren, Europako hainbat herrialdetatik eta baita Kanadatik eta EEBB-tik ere. Hauen artean baziren nazioarte mailan liderrak direnak ere.
Aztertu ziren gaien artean, hauexek zueden: Biofisika eta Biokimikarako garatu diren hainbat algoritmo konputazional berrien bilakaera, minbiziaren aurkako farmako berrien diseinuan izan diren azken aurrerapenak, aluminioaren toxikotasuna giza gorputzetan edo zergatik otarraina gorria bihurtzen den egosterakoan.

Symposium on Theoretical Biochemistry in Donostia.
Computers and computational methods have come to play an increasingly important role in natural sciences. In the area of biochemistry, theoretical modelling is for example used to understand the details governing why certain compounds or chemicals are toxic and others are not, how DNA is effected by UV-radiation, or how to design new and more efficient drugs.
During March 5 - 7, the Donostia International Physics Center, DIPC, along with the theoretical chemistry groups of The University of Uppsala and of the UPV/EHU, which are very active in these areas, organized a symposium on theoretical biochemistry/biophysics. The symposium brought together some 50 participants from Europe and North America, including many leading researchers in the field.
Among the many topics covered at the symposium were recent developments of the theoretical toolbox used by the researchers, as well as applications thereof to develop new antitumour drugs, to explain the toxicity of aluminium, or the intriguing fact that lobsters turn red upon cooking.

Symposium Internacional sobre Biofísica Teórica en el DIPC
Los computadores y los métodos computacionales están adquiriendo una importancia creciente en el desarrollo de todas las Ciencias Naturales. En el área de la bioquímica la modelización computacional se emplea, por ejemplo, para comprender los detalles que gobiernan la toxicidad de algunos compuestos y la benignidad de otros, el efecto de la radiación Ultra-Violeta sobre el ADN, o como diseñar nuevos y más eficaces fármacos.
Del 5 al 7 de marzo, el Donostia International Physics Center, DIPC, junto con el grupo de química teórica de la UPV/EHU y grupo de biofísica de la Universidad de Uppsala (Suecia), organizaron en un Symposium Intenacional sobre Biofísica Teórica. El Symposium contó con la participación de unos 50 delegados de varios países de Europa, Canadá y EEUU, entre los cuales asistieron algunos líderes mundiales en la materia.
Los participantes discutieron los nuevos desarrollos de las herramientas computacionales que se emplean de la Biofísica y Bioquímica modernas, así como avances en fármacos antitumorales, la razones de la toxicidad del aluminio en los organismos vivos o el intrigante hecho de por que la langosta se vuelve roja cuando se cocina.

Participants:
E. Aldaba
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain
J. Andrés
Universitat Jaume I, Spain
I. Alkorta
Instituto de Química Medica (CSIC), Spain
A. Arrieta
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain
M. Barbany
IMIM / Universitat Pompeu Fabra, Spain
R. J. Boyd
Dalhousie University, Canada
N. Dölker
Universitat Autònoma de Barcelona, Spain
M. Duran
Universitat de Girona, Spain
B. Durbeej
Uppsala Universitet, Sweden
L. A. Eriksson
Uppsala Universitet, Sweden
E. Erkizia
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain
M. Eyerbe
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain
S. Ferrer
Universidad de Valencia, Spain
A. Gonzalez-Lafont
Universitat Autònoma de Barcelona, Spain
H. Gutierrez de Terran
IMIM / Universitat Pompeu Fabra, Spain
F. Himo
Royal Institute of Technology, Sweden
A. Largo
Universidad de Valladolid, Spain
J. Llano
Uppsala Universitet, Sweden
B. Lecea
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain
J. M. Lluch
Universitat Autònoma de Barcelona, Spain
X. López
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain
J. M. Matxain
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain
T. Marino
Università della Calabria, Italy
J. M. Mercero
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain
V. Moliner
Universitat Jaume I, Spain
J. I. Mujika
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain
K. Nivesanond
University of Antwerpen, Belgium
M. A. Peña
Universidade de Santiago de Compostela, Spain
J. Poater
Universitat de Girona, Spain
X. Prat-Resina
Universitat Autònoma de Barcelona, Spain
J. Raber
Uppsala Universitet, Sweden
M. Roca
Universitat Jaume I, Spain
J. M. Rodrigo
Noray Bioinformatics, S.L.
A. Rubio
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain
N. Russo
Università della Calabria, Italy
E. San Sebastián
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain
I. Silanes
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain
R. Stote
Université Louis Pasteur, France
I. Tejero
Universitat Autònoma de Barcelona, Spain
J. M. Ugalde
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain
U. Ugalde
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain
J. Villa
IMIM / Universitat Pompeu Fabra, Spain
D. York
University of Minnesota, USA
C. Zhu
Uppsala Universitet, Sweden
A. Zubia
Universidad del País Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea, Spain

Program
March 5
R. J. Boyd Towards the development of theoretical models for biological catalysis.
A. Largo Synthetic routes for interstellar organic and prebiotic molecules.
J. M. Mercero Aluminum interactions with aminoacid side chains in a protein model environment.
B. Durbeej Some applications of time-dependent density functional methods to biochemical
systems.
J. Villa Ion channels: through the hole and over the mountain.
A. González-Lafont On the location of stationary points in enzymatic catalysis: mandelate racemase as an
example
J. I. Mujika Theoretical study of the cleavage of the peptidic bond.
March 6
R. Stole Ligand binding and conformational changes in DNA gyrase B.
V. Moliner Theoretical insights in enzyme catalysis.
N. Russo A DFT investigation of some biomolecular systems.
U. Ugalde Microbial autoinducers: molecular structure and biological function.
E. San Sebastian Molecular modelization of antimetastatic drugs and drug targets.
A. Zubia Antimetastatic drugs: an example of synthesis based on theoretical design.
X. Lopez QM and QM/MM studies on phosphate diester hydrolysis reactions.
March 7
F. Himo DFT studies of radical enzymes.
A. Rubio Optical properties of biomolecules within TDDFT: excited state electron ion dynamics.
M. Duran A new vision of aromaticity through the electron-pair density.
J. LLano Thermochemistry of electron, proton, and proton-coupled electron transfer reactions in
solution.
D. York Computational methods for RNA catalysis.