Zelulen analisi automatizatuan aurrerapenak: MitoEM erronka

Harvardeko Unibertsitateko Konputazio Bisualeko Taldeko ikerlariekin lankidetzan, Donostia Intenational Physics Center (DIPC) eta Euskal Herriko Unibertsitateko (UPV/EHU) ikerlariek urrats esanguratsuak egin dituzte zeluletan energia ekoizteaz arduratzen diren mitokondrioen mundu korapilotsua ulertzeko.

MitoEM erronkaren emaitzen berri eman dute "IEEE Transactions on Medical Imaging" aldizkarian argitaratutako "Current Progress and Challenges in Large-scale 3D Mitochondria Instance Segmentation" artikuluan. Ekimen aitzindaria da, eta mikroskopia elektronikoko irudietatik abiatuta mitokondrioen 3D segmentazioa du ardatz. Gizaki eta arratoien garuneko ehunen irudiak erabili dituzte, mitokondrioen funtsezko funtzionamenduari buruzko informazio paregabea lortuz.

MitoEM erronkak 257 parte-hartzaile, 14 talde emaitzak aurkezten eta erronka-tailerrean aktiboki parte hartu duten sei talde izan ditu. Ebaluazio eta lankidetza zorrotzaren ondoren, taldeak errendimendu handiko zortzi ikuspegi eta bere funtsezko estrategiak ezagutarazi zituen. Kritikoki, haren lanaren ondorioz, egungo segmentazio-metodologiak hobetu zitezkeen funtsezko arloak identifikatu ziren, eta, horren ondorioz, puntuazio-sistema hobetu, emaitza zehatzagoak bermatzeko.

Aurrerapen nabarmenak egin diren arren, ikertzaileek oraindik mitokondrioen morfologia konplexuak zehaztasunez delineatzeko erronka garrantzitsuak daudela diote. Ikerketak irtenbide berritzaileen eta ekarpen berrien etengabeko beharra azpimarratzen du. Baliabide guztiak eskuragarri daude deskargatzeko, eremu dinamiko honetan lankidetza eta aurrerapenak sustatzeko asmotan.